Plateforme d'analyse moléculaires "Biodiversité-Environnement"

Données administratives

•  Nom du laboratoire/structure : Plateforme d'analyses moléculaires « Biodiversité-Environnement »
• Laboratoire labellisé ou antenne de labo labellisé, hébergé par l'IUT (JE, EA, ERT, CNRS), partenariat avec le LPGN UMR 6112 CNRS
• Statut actuel du laboratoire/structure : rattaché à l'IUT - LPG Nantes UMR 6112 CNRS

Présentation scientifique

Mots clés : microbiologie, biodiversité, bactéries, champignons, biologie moléculaire, génomique environnementale, PCR-TTGE, qPCR, environnement, sols pollués, bioremédiation et phytoremédiation.

Présentation générale du laboratoire/structure

• intitulés des équipes de recherche : Plateforme d'analyses moléculaires « Biodiversité-Environnement »
• principales thématiques de recherche :
  •  La plate-forme axe son activité sur l'analyse de la biodiversité microbienne dans tout type de matrices environnementales (eau, sol) et pouvant être élargie à l'agroalimentaire. Ces analyses sont réalisées par des approches classiques de microbiologie et par des techniques moléculaires spécifiques pour l'analyse de la biodiversité microbienne : empreintes moléculaires 16S et 18S (TTGE, qPCR, MiSeq Illumina©).

 Moyens techniques dont dispose le laboratoire

• Petits matériels : ensemble du petit matériel de laboratoire nécessaire aux manipulations de microbiologie.
• Equipement semi-lourd : congélateurs et réfrigérateurs, bains thermostatés, agitateurs, centrifugeuses, 1 thermocycleur Biorad CFX96 (PCR et qPCR), dCODE système (fingerprinting, PCR-TGGE et DGGE), système d'acquisition d'image Gel Doc XR+, logiciels d'analyse bio-informatique FpQuest, fluorimètre, PSM.

• La plateforme d'analyse travaille en partenariat avec des laboratoires universitaires de Nantes et Angers et peut accéder à de nombreux autres matériels de recherche (dont MEB, phytotron, ICP-MS, ICP-OES pour le dosage des métaux)

Programmes de recherche dans lesquels la plate-forme est impliquée

• Projet Régional Pollusols (cliquez sur ce lien)
   
• ANR JASSUR : caractérisation de sols et de la biodiversité dans les jardins urbains de Marseille, Nantes et Nancy (http://www6.inra.fr/jassur)

Implications dans les enseignements

Le laboratoire a pour vocation à accueillir des stagiaires de tout niveau (L3, Master 1 et 2). Des enseignements spécialisés sur les techniques de biologie moléculaire et d'analyses moléculaires sont dispensés à l'IUT.